ينبثق عن الوحدة عدة لجان لتسيير أمور العمل بها و تحقيق الغايات والأهداف وهذه اللجان هي:-
1- لجنة التخطيط الاستراتيجي: -
تتكون اللجنة من رئيس اللجنة و هو المدير التنفيذي لوحدة ضمان الجودة أو أحد نوابه إن كان منتدباً من خارج المعهد و منسق اللجنة أحد أعضاء هيئة التدريس و ثلاثة من أعضاء هيئة التدريس أو الهيئة المعاونة أو الادريين , و تختص بتحديث الخطة الاستراتيجية والتقارير الدورية لتنفيذها.
2- لجنة شئون أعضاء هيئة التدريس والبحث العلمي: -
تتكون اللجنة من رئيس اللجنة و هو المدير التنفيذي لوحدة ضمان الجودة أو أحد نوابه إن كان منتدباً من خارج المعهد و منسق معيار أعضاء هيئة التدريس و البحث العلمي وعضوان من أعضاء هيئة التدريس أو معاونيهم ومسئول وحدة شئون أعضاء هيئة التدريس ومدير وحدة التدريب, و تختص بجميع أوجه نشاط الوحدة في مجال البحث العلمي و شئون أعضاء هيئة التدريس و طرق التحسين و التطوير في هذه المجالات.
3- لجنة المعايير والبرامج الاكاديمية: -
تتكون اللجنة من رئيس اللجنة وهو المدير التنفيذي لوحدة ضمان الجودة أو أحد نوابه إن كان منتدباً من خارج المعهد ومنسق المعايير و البرامج الاكاديمية ورؤساء الأقسام العلمية بالمعهد او من ينوب عنهم و تختص بكل ما له علاقة بالتعليم و التعلم و تطوير و تحديث البرامج و المقررات الدراسية.
4- لجنة متابعة وتقييم الموارد البشرية: -
تتكون اللجنة من نائب مدير وحدة ضمان الجودة وأمين عام المعهد والمدير الإداري للمعهد ومدير وحدة التدريب ورئيس قسم إدارة شئون العاملين والشئون الإدارية ورئيس قسم الحسابات، وتختص بإدارة ومتابعة وتقويم الموارد البشرية بالمعهد من تعينات وتوزيع تخصصات وتدريب ورفع مستوى الإداريين وقياس مدى رضائهم واقتراح آليات التقديم والتحسين بهذا الخصوص على إدارة المعهد.